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新冠病毒P.1和B.1.351突变株基因组RNA标准物质
作者:董莲华     来源: 中国计量科学研究院      点击次数:244      更新时间:2021-12-09 点击分享

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当前,新冠病毒疫情仍然在全球范围内肆虐,截止到11月30日,全球感染人数超2.6亿,死亡人数超500万。我国疫情虽然得到了较好的控制,但当前防控工作内防反弹,外防输入,形势依然非常严峻。此外,新冠病毒不断变异,导致其传染性更强。主要的突变株包括:B.1.617.2(Delta)、B.1.1.7(Alpha)、B.1.351(Beta)、P.1(Gamma)、B.1.1.529(Omicron)等。虽然目前的研究表明这些突变尚未对疫苗的有效性产生显著的影响,但针对突变株的监测和防控工作绝不能放松。

近日中国计量科学研究院联合北京科兴中维生物技术有限公司,在继今年8月开发的B.1.617.2(Delta)突变株基础上,又针对新冠病毒P.1(Gamma)和B.1.351(Beta)突变株开发了全基因组RNA标准物质。该标准物质以新冠病毒P.1和B.1.351突变株为候选物,对其灭活后进行基因组RNA纯化、序列表征和量值确定。该标准物质可以作为测量标准用于新冠病毒P.1和B.1.351突变株检测方法的方法开发、方法确认和质量控制。

该标准物质涵盖新冠病毒P.1和B.1.351突变株的全部序列,高通量测序结果表明不存在其他病毒序列。采用经过国际比对验证的数字PCR方法,对开放阅读框(ORF1ab)基因、核衣壳蛋白N基因、包膜蛋白E基因和刺突蛋白S基因进行了准确定值。特性量值为每管溶液中含有的新冠病毒P.1或B.1.351突变株的ORF1ab、N、E和S基因的拷贝数浓度。具体量值见表1。

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新冠病毒P.1突变株基因组RNA标准物质的基因组序列中S基因具体的变异位点包括:L18F、T20N、P26S、D138Y、R190S、K417T、E484K、N501Y、D614G、H655Y、T1027I、V1176F,具体见图1。

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图1. 新冠病毒P.1突变株S基因突变位点

新冠病毒B.1.351突变株基因组RNA标准物质的基因组序列中S基因具体的变异位点包括:L18F、D80A、D215G、K417N、E484K、N501Y、D614G、H655Y、A701V、F1121V,以及L241、L242和A243缺失,具体见图2。

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图2. 新冠病毒B.1.351突变株S基因突变位点

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