GBW09352-GBW09353(原编号NIM-RM4623)
转录组测序内参标准物质(51基因)
转录组测序内参标准物质(100基因)
转录组测序(RNA-seq)是解析生命活动与发现疾病生物标志物的核心工具。然而,受限于实验建库的批次效应(系统偏差)和基因序列差异(序列依赖性偏差),高通量测序长期受困于“相对比较”的局限中,面临着跨平台数据整合困难与测量结果重复性不足的严峻挑战。
目前国际上使用的ERCC等转录组控制物,在评估测序平台技术性能和监测基因相对表达变化方面发挥了重要作用。然而,精准医学的深入发展对跨平台数据整合及临床通用决策阈值的建立提出了更高要求。由于现有控制物普遍缺乏国际单位制(SI)溯源的绝对量值,难以满足这一迫切需求。为彻底打破该技术瓶颈,中国计量科学研究院创新推出了转录组测序内参标准物质(GBW09352-GBW09355)。该系列标准物质是国际首套具备SI溯源性的转录组绝对定量校准。其采用计量学高等级的同位素稀释质谱法(IDMS)进行定值,量值溯源至SI单位摩尔(mol)。在实际应用中,将该标准物质作为内参加入待测样本,同管进行建库、测序与数据分析,即可精准实现待测基因拷贝数的绝对定量,并从根本上实现了同一样本内不同基因表达量的精确可比。
该系列标准物质包含两套,用户可根据具体应用场景的动态范围需求进行选择:转录组测序内参标准物质(51基因)(GBW09352-GBW09353)、转录组测序内参标准物质(100基因)(GBW09354-GBW09355)。每套产品均包含“水平一”和“水平二”两管。标准值包括每个水平的各基因绝对拷贝数浓度,以及水平一与水平二之间的拷贝数浓度比值(Fold-change),全面满足单样本绝对定量与跨样本比值质控的需求。
51基因体系(GBW09352-GBW09353)聚焦微小差异分辨,水平一和水平二的基因表达比值跨度(log2FC)约为-2到2,适用于对测序算法或流程捕捉微小生物学差异能力的精细评估与质控;100基因体系(GBW09354-GBW09355)提供超宽动态范围,基因数量更多,且水平一和水平二的比值跨度更大(log2FC约为-4到5),适用于全转录组的广谱表达分析、建立极宽动态范围的绝对定量校准曲线。
在生信分析与数据转化层面,该体系已完成充分的性能确认,用户可直接采用整合了本标准物质与人类参考基因组的序列文件及注释文件。同时,体系还配套提供了从常规表达矩阵实现基因绝对定量质控和转化的分析流程。上述序列文件与分析代码均支持开放下载获取。
该系列标准物质广泛适用于转录组测序(RNA-seq)全流程的测量质量控制、方法确认与验证、试剂盒评价等。可为医疗机构、第三方检验医学实验室及体外诊断企业的相关检测提供坚实的计量依据,支撑高通量测序基因表达定量检测的方法学验证,为建立基于“分子拷贝数”的通用临床决策阈值提供基准支撑,以精准的绝对定量全面助力高通量测序技术的规范化推广与临床落地。
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